代表药物：ChondroCelect（审批政府，欧盟；上市年份，2009）&Maci（审批政府，美国；上市年份，2016）。Maci的整个治疗过程大致描述如下：先将患者自体细胞提取出来，进行体外扩增，达到一定数量以后，放入生物可吸收的猪源性胶原蛋白膜进行组装，最后由经过专门训练的外科医生放入人体关节面上的软骨损伤区域。Maci 种植体上装载有大量的软骨细胞，约为每平方厘米 50 万到 100 万个。植入 Maci 的数量取决于患者软骨损伤的范围大小，最终要保证损伤区域完全覆盖。 通过这样的方法可以为患者重新再生软骨，再次活动自如，不再受关节疼痛的折磨。

代表药物：Hearticellgram-AMI（审批政府，韩国；上市年份，2011）&Multistem（审批政府，美国；上市年份，2012）& Prochmal （审批政府，加拿大；上市年份，2012）&Temcell（审批政府，日本；上市年份，2016）。这四种干细胞药物治疗的疾病类型并不相同。Hearticellgram-AMI主要治疗的是急性心梗；Multistem主要处理I型粘多糖贮积症（MPS-I）和创伤等病症；Prochmal和Temcell均应用于GVHD（移植物抗宿主病）等。Hearticellgram-AMI是从患者自身骨髓中提取间充质干细胞，移植注入冠状动脉，再生受损细胞，恢复心脏功能，主要用于急性心肌梗死的病人。Hearticellgram-AMI获准用于急性心肌梗死治疗主要是基于6年的临床试验及干细胞治疗心肌梗死临床治疗效果。研究发现，干细胞移植6个月后，患者左室射血分数改善6%。密歇根大学的心脏病专家马克拉塞尔认为，左室射血分数改善6%，病情可达到最大程度的改善。

代表药物：Hemacord（审批政府，美国；上市年份，2011）&Cartistem（审批政府，韩国；上市年份，2012）&Strimvelis（审批政府，美国；上市年份，2016）。Hemacord常被用来治疗一些遗传性或者获得性血液系统疾病；Cartistem则用于诸如软骨损伤及退行性关节疾病等的治疗；Strimvelis主要针对的是儿童ADA-SCID免疫缺陷症。Strimvelis疗法是从患者的骨髓中取出干细胞，通过转导将一个正常拷贝的ADA基因导入干细胞，然后采取静脉输注将干细胞重新导入患者体内，之后一部分干细胞会归巢至骨髓。该疗法已在18个患儿身上实施，最早一例是在15年前。目前这18例接受Strimvelis治疗的ADA-SCID患者仍然存活。一项关键性研究显示，所有儿科ADA-SCID患者接受Strimvelis治疗后3年的存活率达100%。Strimvelis只需给药一次，而且不依赖于第三方捐献者，不存在因排斥引发的免疫不相容风险。

代表药物：Cuepistem(审批政府，韩国；上市年份，2012)& Alofisel(审批政府，欧盟；上市年份，2018)。这两种药物均主要用于克罗恩病的治疗。Alofisel(Darvadstrocel,前期名称为Cx601)，是一种局部注射的同种异体脂肪源性干细胞悬浮液，由TiGenix研制，这是一种从人体脂肪组织中分离并在体外培养扩增的脂肪源性干细胞（ASC），ASC分泌的细胞因子具有调节免疫系统和抑制炎症的作用，因此被认为具有治疗克罗恩病患者的潜力。克罗恩病是一种慢性胃肠道炎症性疾病，CPF是该病可能发生的一种并发症，可导致肛周肿痛、流脓、感染以及大便失禁，严重影响患者生活质量。目前，克罗恩病患者的临床治疗选择十分有限。

代表药物：Holoclar（审批政府，意大利；上市年份，2015）。Holoclar由意大利凯西制药（Chiesi Farmaceutici）研发。Holoclar是一种活组织产品，类似于一个隐形眼镜，其活性物质为“离体扩增（ex-vivo）的包含干细胞的自体人角膜上皮细胞”，由取自患者角膜未受损区域的一小片活组织制备并在实验室利用细胞培养技术生长而成，可用于替代受损的角膜细胞。其中，角膜缘干细胞负责角膜上皮的连续再生和维持。通过在眼球重建干细胞储备，Holoclar能够启动正常的角膜细胞生长和维持。Holoclar不仅能够作为角膜移植的替代疗法，也可以在大范围眼部损伤的情况下增加角膜移植成功的概率。在临床试验中，Holoclar能够修复眼部角膜损伤，并改善或解决疼痛、畏光等症状，同时可改善患者的视敏度(visual acuity)。